Valitsus otsustas avalikustada komisjoni aruande, mille kohaselt möönsid toonase rahvusvahelise uurimiskomisjoni liikmed, et nende lõpparuandes esineb vastuolusid järelduste ja pääsenute ütluste vahel, mis puudutavad vöörirambi avanemist ja tunnistajate poolt õnnetuse alguse tajutud tõukeid.

Valitsuse komisjoni esimehe, juhtiva riigiprokuröri Tarmo Kurmi aruande kohaselt ei suutnud rahvusvahelise komisjoni liikmed neid ebakõlasid kõrvaldada, mis vähendab lõpparuande usaldusväärsust.

Aruanne heidab lõppraportile ette ka seda, et selles on puudutatud autoteki alla jäävate tekkide täitumist veega vaid põgusalt ning küsimusele pole uurimises ka piisavalt tähelepanu pööratud. Valitsuskomisjon leiab, et kuna pole täpselt välja selgitatud, millal ja kuidas pääses vesi autoteki all, ei ole ka võimalik laeva uppumist kirjeldada.

Komisjon leiab ka, et lõpparuandes esitatud laevahuku versiooni muudab raskesti kaitstavaks asjaolu, et puudub kvaliteetne filmimaterjal laevakerest. Aruande kohaselt on olemasolev materjal katkendlik ja häiretega ning filmimaterjali, millest nähtuks laevakere põhjaosa süstemaatiline uurimine ja filmimine, pole olemas.

Valitsuskomisjoni hinnangu välistab rahvusvahelise uurimiskomisjoni lõppraport aga kindlalt vöörivisiiri purunemise plahvatuse tagajärjel, sest tehtud on terve rida uuringuid, millest ükski seesugust versiooni ei kinnita.

Asjatundjate komisjon vastas oma aruandes küsimustele, mis tõstatusid pärast Rootsi valitsuse uurimist 2004. aastal, kus selgitati Rootsi sõjaväeluure korraldatud sõjatehnika veo asjaolusid.

Eelmise aruande avalikustas komisjon aasta eest, milles ei leitud relvaveo kohta täiendavaid andmeid, kuid komisjoni hinnangul olid Estonia huku rahvusvahelise uurimiskomisjoni lõpparuandes osad järeldused nõrgalt tõenditega kaetud.

Lisaks valitsusele uuris relvavedu ka riigikogu komisjon, mis leidis, et Eesti ametkonnad ega ametiisikud polnud Estonia sõjatehnika vedudest teadlikud, kuid Rootsile võis tehnikavedudel abi osutada mõni Eesti ametnik eraviisiliselt.

Komisjoni järgmise aruande esitamise tähtaeg on 15. oktoober 2007.

Justiitsminister Rein Lang ütles valitsuse pressikonverentsil, et Rootsi poole raport Estonia huku uurimise osas valmib 2009. aastal.