Valimisteenistusel on kohustus e-hääled säilitada alates valimispäevast ühe kuu jooksul kuni kõigi valimiskaebuste kohta on tehtud lõplikud otsused.

Seejärel hävitatakse avalikult elektroonilised hääled, elektroonilise hääletamise süsteemis sisalduvad isikuandmed ning elektrooniliste häälte avamise võti.

Häälte avamist võimaldav privaatvõti on jaotatud osakuteks ning väljastatud vabariigi valimiskomisjoni liikmetele ja riigi valimisteenistuse töötajatele.

E-häälte avamise võtme hävitamisega muudetakse Euroopa Parlamendi valimistel antud e-hääled loetamatuks. Samuti hävitatakse kõvaketas, mida kasutati privaatvõtme loomiseks.

Samuti hävitab iga omavalitsus paberhääled. Nii e-hääled kui paberhääled hävitatakse selleks, et tagada ka tulevikus häälte salajasus ning välistada nende avamine.